施莱德的残党启动“时空崩裂器”，将李奥纳多、多纳泰罗、米开朗基罗和拉斐尔分别打入四个截然不同的平行宇宙——蒸汽朋克纽约、恐龙主宰的世界、全员性转版本和黑白默片风格的地狱厨房。每个神龟都必须找到当地版本的“自己”，并说服他们相信多元宇宙危机。更棘手的是，八个神龟性格迥异，有的胆小，有的暴虐。他们必须组成临时团队，在反派联盟“跨维度脚族”追杀下，修复时空信标。第五季加入了大量致敬漫画经典的彩蛋，最终战需要所有神龟同时说出“卡哇邦嘎”才能激活合体技。
系列最佳一季。平行宇宙设定让老粉狂喜，每个宇宙的画风和笑点都精心设计。兄弟四人被迫分开反而强化了羁绊主题。新角色“暗黑李奥”的人气直逼主角团。
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